Bioinformatic and statistical analysis of adaptive immune repertoires

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Autor:innen
Menzel, Ulrike
Reddy, Sai T.
Autor:in (Körperschaft)
Publikationsdatum
10/2015
Typ der Arbeit
Studiengang
Sammlung
Institut für Medizintechnik und Medizininformatik
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Typ
01A - Beitrag in wissenschaftlicher Zeitschrift
Herausgeber:innen
Herausgeber:in (Körperschaft)
Betreuer:in
Übergeordnetes Werk
Trends in Immunology
Themenheft
DOI der Originalpublikation
https://doi.org/10.1016/j.it.2015.09.006
URI
https://irf.fhnw.ch/handle/11654/46901
Link
Reihe / Serie
Reihennummer
Jahrgang / Band
36
Ausgabe / Nummer
11
Seiten / Dauer
738-749
Patentnummer
Verlag / Herausgebende Institution
Cell Press
Verlagsort / Veranstaltungsort
Auflage
Version
Programmiersprache
Abtretungsempfänger:in
Praxispartner:in/Auftraggeber:in
Zusammenfassung
High-throughput sequencing (HTS) of immune repertoires has enabled the quantitative analysis of adaptive immune responses and offers the potential to revolutionize research in lymphocyte biology, vaccine profiling, and mono clonal antibody engineering. Advances in sequencing technology coupled to an exponential decline in sequencing costs have fueled the recent over whelming interest in immune repertoire sequencing. This, in turn, has sparked the development of numerous methods for bioinformatic and statistics-driven interpretation and visualization of immune repertoires. Here, we review the current literature on bioinformatic and statistical analysis of immune reper toire HTS data and discuss underlying assumptions, applicability, and scope. We further highlight important directions for future research, which could propel immune repertoire HTS to becoming a standard method for measuring adaptive immune responses.
Schlagwörter
Fachgebiet (DDC)
600 - Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften
Projekt
Veranstaltung
Startdatum der Ausstellung
Enddatum der Ausstellung
Startdatum der Konferenz
Enddatum der Konferenz
Datum der letzten Prüfung
ISBN
ISSN
1471-4906
1471-4981
Sprache
Englisch
Während FHNW Zugehörigkeit erstellt
Ja
Publikationsstatus
Veröffentlicht
Begutachtung
Peer-Review der ganzen Publikation
Open Access-Status
Closed
Lizenz
Zitation
GREIFF, Victor, Enkelejda MIHO, Ulrike MENZEL und Sai T. REDDY, 2015. Bioinformatic and statistical analysis of adaptive immune repertoires. Trends in Immunology. Oktober 2015. Bd. 36, Nr. 11, S. 738–749. DOI 10.1016/j.it.2015.09.006. Verfügbar unter: https://irf.fhnw.ch/handle/11654/46901
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