Signatures of gene expression noise in cellular systems
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Autor:innen
Autor:in (Körperschaft)
Publikationsdatum
2009
Typ der Arbeit
Studiengang
Sammlung
Typ
01A - Beitrag in wissenschaftlicher Zeitschrift
Herausgeber:innen
Herausgeber:in (Körperschaft)
Betreuer:in
Übergeordnetes Werk
Progress in Biophysics and Molecular Biology
Themenheft
DOI der Originalpublikation
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Reihe / Serie
Reihennummer
Jahrgang / Band
100
Ausgabe / Nummer
1-3
Seiten / Dauer
57-66
Patentnummer
Verlag / Herausgebende Institution
Elsevier
Verlagsort / Veranstaltungsort
Auflage
Version
Programmiersprache
Abtretungsempfänger:in
Praxispartner:in/Auftraggeber:in
Zusammenfassung
Noise in gene expression, either due to inherent stochasticity or to varying inter- and intracellular environment, can generate significant cell-to-cell variability of protein levels in clonal populations. To quantify the different sources of gene expression noise, several theoretical studies have been performed using either a quasi-stationary approximation for the emerging master equation or employing a time-dependent description, when cell division is taken explicitly into account. Here, we give an overview of the different origins of gene expression noise which were found experimentally and introduce the basic stochastic modeling approaches. We extend, and apply a time-dependent description of gene expression noise to experimental data. The analysis shows that the induction level of the transcription factor can be employed to discriminate the noise profiles and their characteristic signatures. On the basis of experimentally measured cell distributions, our simulations suggest that transcription factor binding and promoter activation can be modeled independently of each other with sufficient accuracy.
Schlagwörter
Fachgebiet (DDC)
600 - Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften
Veranstaltung
Startdatum der Ausstellung
Enddatum der Ausstellung
Startdatum der Konferenz
Enddatum der Konferenz
Datum der letzten Prüfung
ISBN
ISSN
0079-6107
1873-1732
1873-1732
Sprache
Englisch
Während FHNW Zugehörigkeit erstellt
Nein
Publikationsstatus
Veröffentlicht
Begutachtung
Peer-Review der ganzen Publikation
Open Access-Status
Closed
Lizenz
Zitation
RAUSENBERGER, Julia, Christian FLECK, Jens TIMMER und Markus KOLLMANN, 2009. Signatures of gene expression noise in cellular systems. Progress in Biophysics and Molecular Biology. 2009. Bd. 100, Nr. 1-3, S. 57–66. DOI 10.1016/j.pbiomolbio.2009.06.003. Verfügbar unter: https://irf.fhnw.ch/handle/11654/45742