Quantifying origins of cell-to-cell variations in gene expression
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Autor:innen
Kollmann, Markus
Autor:in (Körperschaft)
Publikationsdatum
15.11.2008
Typ der Arbeit
Studiengang
Sammlung
Typ
01A - Beitrag in wissenschaftlicher Zeitschrift
Herausgeber:innen
Herausgeber:in (Körperschaft)
Betreuer:in
Übergeordnetes Werk
Biophysical Journal
Themenheft
DOI der Originalpublikation
Link
Reihe / Serie
Reihennummer
Jahrgang / Band
95
Ausgabe / Nummer
10
Seiten / Dauer
4523-4528
Patentnummer
Verlag / Herausgebende Institution
Cell Press
Verlagsort / Veranstaltungsort
Auflage
Version
Programmiersprache
Abtretungsempfänger:in
Praxispartner:in/Auftraggeber:in
Zusammenfassung
A general dynamic description of protein synthesis was employed to quantify different sources of gene expression noise in cellular systems. To test our approach, we use time-resolved expression data of individual human cells and, from this information, predict the stationary cell-to-cell variation in protein levels in a clonal population. For three of the four human genes investigated, the cellular variations in expression level are not due to fluctuations in promoter activity or transcript copy number, but are almost exclusively a consequence of long-term variations of gene regulatory factors or the global cellular state. Moreover, we show that a dynamic description is much more reliable to discriminate extrinsic and intrinsic sources of noise than it is on grounds of cell-cycle averaged descriptions. The excellent agreement between the theoretical predictions and the experimentally measured noise strengths shows that a quantitative description of gene expression noise is indeed possible on the basis of idealized stochastic processes.
Schlagwörter
Fachgebiet (DDC)
600 - Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften
Veranstaltung
Startdatum der Ausstellung
Enddatum der Ausstellung
Startdatum der Konferenz
Enddatum der Konferenz
Datum der letzten Prüfung
ISBN
ISSN
0006-3495
1542-0086
1542-0086
Sprache
Englisch
Während FHNW Zugehörigkeit erstellt
Nein
Publikationsstatus
Veröffentlicht
Begutachtung
Peer-Review der ganzen Publikation
Open Access-Status
Closed
Lizenz
Zitation
RAUSENBERGER, Julia und Markus KOLLMANN, 2008. Quantifying origins of cell-to-cell variations in gene expression. Biophysical Journal. 15 November 2008. Bd. 95, Nr. 10, S. 4523–4528. DOI 10.1529/biophysj.107.127035. Verfügbar unter: https://irf.fhnw.ch/handle/11654/45743